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树木的通用分子标记引物及其联合开发方法和应用
审中-实审

Universal molecular marker primer for tree and joint development method and application thereof

申请号:201710614076.7 申请日:2017-07-25
摘要:本发明公开了一种树木的通用分子标记引物及其联合开发方法和应用,其中,本发明采用三种分子标记联合开发的方法,规避了单一分子标记的局限性,如SSR序列两侧序列种间保守性较低,这大大限制了SSR标记在其他物种中的利用,ILP标记和IP仅存于染色体基因区段,对于其他非编码区间则不能使用该方法,多种分子标记方法的联合使用将每种标记的优势相结合,结果更加客观;采用本发明的方法获得的树木的SSR、ILP和PIP通用分子标记引物,不仅克服了目前树木分子标记较少、标记通用性较低、树木品种难以区分的问题,而且还可以提高树木品种鉴定结果的准确性。
Abstract: The invention discloses a universal molecular marker primer for trees and a joint development method and application thereof, wherein the joint development method of three molecular markers is adopted, the limitations of single molecular markers such as the inter-species conservation of the SSR sequences on the two sides is relatively low are circumvented, this greatly limits the use of SSR markers in other species, the ILP markers and IP exist only in the chromosomal gene segment, for other non-coding intervals the method cannot be used, the joint use of multiple molecular marker method combines the advantages of each marker, the result is more objective; the general molecular marker primers SSR, ILP and PIP for trees obtained using the method hereof provide a solution for the problems that currently the molecular markers for trees are relatively few, the universality of the markers is relatively low, and the tree species are difficult to distinguish, and the method is capable of improving the accuracy of the identification results of tree species.
申请人: 山东农业大学
Applicant: UNIV SHANDONG AGRICULTURAL
地址: 271018 山东省泰安市岱宗大街61号
发明(设计)人: 杨龙 桑亚林 夏信瑶 栾琳琳
Inventor: YANG LONG; SANG YALIN; XIA XINYAO; LUAN LINLIN
主分类号: C12Q1/68(2006.01)I
分类号: C12Q1/68(2006.01)I C12N15/11(2006.01)I
  • 法律状态
2017-10-24  实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q 1/68申请日:20170725
2017-09-22  公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
  • 其他信息
主权项  1.树木的SSR、ILP和PIP通用分子标记引物的联合开发方法,其特征在于,包括以下步 骤:
Step1:SSR位点和intron位点扫描
从公共数据平台下载全部树木基因组序列和基因组注释信息,扫描基因组序列中的 SSR位点、intron位点和预测intron位点,获得相应的位点信息;
Step2:引物设计
基于上一步获得的位点信息,利用perl程序,提取出位点两侧长度为60bp的DNA序列做 为引物前体,然后利用eprimer3软件进行引物设计,设计好的引物成对存在;
Step3:ePCR验证
结合所下载的树木基因组序列,利用Linux平台上的ePCR软件对设计好的引物进行电 子模拟PCR,如果一对引物在所下载的全部物种电子模拟PCR中都扩增出了条带,则该对引 物即为一个通用分子标记。
公开号  107190096A
公开日  2017-09-22
专利代理机构  北京世誉鑫诚专利代理事务所(普通合伙) 11368
代理人  刘玲玲
颁证日  
优先权  
 
国别 优先权号 优先权日 类型
CN  201710614076  20170725 
国际申请  
国际公布  
进入国家日期  
  • 专利对比文献
类型 阶段 文献号 公开日期 涉及权利要求项 相关页数
SEA  CN1632117A  20050629  1-7  全文 
SEA  CN1769492A  20060510  1-7  全文 
SEA  CN103409418A  20131127  1-7  全文 
SEA  CN103993074A  20140820  1-7  全文 
SEA  CN105063035A  20151118  1-7  全文 
SEA  CN105063036A  20151118  1-7  全文 
SEA  CN106701960A  20170524  1-7  全文 
注:不保证该信息的有效性、完整性、准确性,以上信息也不具有任何效力,仅供参考。使用前请另行委托专业机构进一步查核,使用该信息的一切后果由用户自行负责。
X:单独影响权利要求的新颖性或创造性的文件;
Y:与检索报告中其他 Y类文件组合后影响权利要求的创造性的文件;
A:背景技术文件,即反映权利要求的部分技术特征或者有关的现有技术的文件;
R:任何单位或个人在申请日向专利局提交的、属于同样的发明创造的专利或专利申请文件;
P:中间文件,其公开日在申请的申请日与所要求的优先权日之间的文件,或会导致需核实该申请优先权的文件;
E:单独影响权利要求新颖性的抵触申请文件。
  • 期刊对比文献
类型 阶段 期刊文摘名称 作者 标题 涉及权利要求项 相关页数
SEA  《Russian Journal of Genetics》  L. Huangb et al.  Large Scale Development of PIP and SSR Markers and Their Complementary Applied in Nicotiana1  1-7  第827-838页 
L. HUANGB ET AL.: "Large Scale Development of PIP and SSR Markers and Their Complementary Applied in Nicotiana1", 《RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS》 
SEA  《中国优秀硕士学位论文全文数据库 农业科技辑》  曹恒春  烟草特异性分子标记的开发与遗传育种数据库的构建  1-7  第11页第2.2.1节、第13页第2.2.2节 
曹恒春: "烟草特异性分子标记的开发与遗传育种数据库的构建", 《中国优秀硕士学位论文全文数据库 农业科技辑》 
  • 书籍对比文献
类型 阶段 书名 作者 标题 涉及权利要求项 相关页数
  • 附加信息
同族专利
 
引用文献
CN103409418ACN103993074ACN105063035A
CN105063036ACN106701960ACN1632117A
CN1769492A
 
被引用文献
CN107557362A